🔥 AHORRA 350€ en la matrícula del Máster de Salud Hormonal

Ilustración médica del sistema digestivo humano destacando el ecosistema de bacterias y microorganismos que forman la microbiota intestinal.

¿Por qué estudiar microbiota intestinal en 2026? Claves clínicas

En el panorama actual de la salud, el abordaje del paciente crónico está sufriendo un cambio de paradigma radical. Para comprender este fenómeno, nos sentamos a charlar con Antonio Valenzuela, codirector del Máster de Microbiota de Regenera, fisioterapeuta y experto en Psiconeuroinmunología (PNI) Clínica. A través de esta entrevista, analizamos desde la perspectiva evolutiva y científica los motivos clínicos definitivos que responden a una pregunta obligatoria para cualquier profesional sanitario: por qué estudiar microbiota.

¿Por qué estudiar microbiota 2026? El 360 de la fisiología

Lorena (Regenera): Abordar a un paciente de estos difíciles, que no terminan de mejorar, que presentan muchas recidivas, cuyos tratamientos a lo mejor no funcionan… ¿Crees que es posible hoy en día abordarlo sin tener en cuenta su microbiota?

Antonio Valenzuela: A ver, abordarlo sí… pero otra cosa es que obtengas los resultados esperados. De hecho, muchas de las intervenciones que hoy día se plantean para mejorar a un paciente crónico, o un paciente de los que vemos hoy día en consulta, son indicaciones que van indirectamente hacia mejorar la microbiota.

Es curioso porque cuando tú miras, por ejemplo, los mecanismos de acción de una estatina, parte de los beneficios que tienen es por la modulación que hacen de la microbiota intestinal. Es algo sorprendente. Sabemos que la estatina reduce el riesgo cardiovascular, pero no tenemos muy claro por qué, porque verdaderamente el impacto que tiene el colesterol sobre el riesgo cardiovascular no es tan alto. Ahora te das cuenta de que la estatina tiene un efecto a nivel de la microbiota.

Pasa lo mismo con la metformina, ese fármaco tan utilizado en el manejo de la resistencia a la insulina y de la diabetes para mejorar la sensibilidad a la insulina. Parte de los beneficios que tiene la metformina vienen por la modulación de la microbiota intestinal. Y de hecho, sabemos que en personas en las cuales esa metformina no mejora al paciente, es porque no tienen ese efecto beneficioso a nivel de la microbiota. La microbiota es ese eje 360 que conecta la fisiología de nuestro organismo.

El Homo Sapiens como “Holobionte”: Genética vs. Estilo de vida

Lorena: El programa formativo del máster tiene un hilo conductor muy ordenado que enlaza cada asignatura con un enfoque integrativo ligado al estilo de vida del paciente (sistema inmune, metabolismo, etc.). ¿Cómo se aterriza este enfoque en la práctica clínica personalizada?

Antonio Valenzuela: A mí el concepto de medicina integrativa me gusta, pero me gusta más el de psiconeuroinmunológica. Regenera es la casa de la PNI, y esa impronta está en el Máster de Microbiota. Lo he recogido a fondo en la primera asignatura, que habla de ese “olobionte” (holobionte) que somos nosotros.

La mayor parte de las patologías que hay hoy día se generan en un conflicto entre nuestro texto —nuestra genética— y el contexto o estilo de vida. Nosotros tenemos una genética muy marcada que evolucionó en un contexto de cazadores-recolectores, en un contexto paleolítico. El mundo ha cambiado totalmente de forma que lo que esperan nuestros genes no es lo que reciben, y ahí se genera ese conflicto que desemboca en patología.

Nosotros no solo somos nuestros 23.000 genes más los 37 genes mitocondriales; somos entre 2 y 20 millones de genes provenientes de la microbiota. Cuando la microbiota recibe lo que espera, produce una serie de sustancias beneficiosas para nuestra salud. Y eso que recibe la microbiota no es solo alimento. ¿Cómo duerme el paciente? ¿Qué niveles de estrés tiene? El ejercicio físico, los retos térmicos… todo eso impacta directamente en la microbiota.

Casos clínicos reales tras estudiar microbiota intestinal (y PNI)

Caso 1: La intolerancia a la histamina y el déficit de DAO

Antonio Valenzuela: Un caso muy característico es la hipersensibilidad o intolerancia a la histamina por déficit de la enzima DAO (diamino oxidasa). Cuando tenemos déficit de esa enzima, se acumula más histamina en el organismo al consumir determinados alimentos (curados, cacao, chocolate, vino tinto, chucrut, etcétera). Convencionalmente se reducen estos alimentos porque el problema se busca solo en la histamina de la dieta. Pero pasan dos cosas:

  1. La mayor parte de la enzima DAO la genera la propia microbiota. Cuando hay un desorden de microbiota, vamos a tener menos DAO a nivel histológico.
  2. Los mastocitos pueden producir histamina en cantidades mucho más altas que las que encuentras en la dieta.

Sabemos que comer con estrés, comer con miedo o la ansiedad —ese sistema nervioso desregulado— te genera un problema con la histamina tan grande que ya puedes hacer la dieta más restrictiva del mundo, que nunca vas a mejorar. ¿Por qué? Porque la histamina la está produciendo tu propio cuerpo. Cuando miras al paciente de forma integrativa, más holística, actúas a nivel de su microbiota, mejorando una microbiota específica que va a producir esa DAO, ayudando a reducir la inflamación del intestino y mejorando esos ámbitos de la vida del paciente. Ahí obtienes una mejoría exponencial.

Caso 2: El error alopatizado en el tratamiento del SIBO

Antonio Valenzuela: Lo vemos también muy claro con los famosos casos de SIBO (de sulfuro, de metano o de hidrógeno). El SIBO es un sobrecrecimiento de bacterias en el intestino delgado, cuando su principal hogar debería ser el intestino grueso. Cuando colonizan el intestino delgado, te producen esa “fiesta de gases” y un disconfort que resta muchísima calidad de vida.

El tratamiento convencional es dar el famoso antibiótico rifaximina —que ojo, a veces hay que darlo y es muy interesante—. En el enfoque integrativo tenemos alternativas herbáceas (clavo, aceite de orégano, semillas de papaya) que funcionan muy bien para regular esa microbiota intestinal. Pero si solo hacemos eso, estamos “alopatizando” el concepto integrativo de la salud: cambias el antimicrobiano médico por uno natural, y al final lo único que haces es poner un parche tras otro.

Tenemos que ver que el SIBO de esa persona viene, a lo mejor, porque come con voracidad y ansiedad debido a un sistema nervioso desregulado, o porque tiene una resistencia a la insulina, una alteración del sueño, o porque la disbiosis empieza en la boca.

Una persona con disbiosis en la boca traga saliva miles de veces al día. Esa saliva llega al estómago. En condiciones normales, el ácido clorhídrico acabaría con esa bacteria tragada de una boca no saludable. ¿Pero qué pasa cuando tenemos un estómago como el de la mayoría de nuestros pacientes, que no produce el ácido clorhídrico suficiente? Esas bacterias llegan vivas al intestino delgado. A nivel de microbiota tendremos que regular boca y estómago, pero viendo al paciente en su totalidad. Cuando ese paciente empieza a comer de forma más relajada, pierde el miedo a comer e integra herramientas 360 (retos térmicos, sueño, etc.), todo su sistema de capacidad digestiva mejora. Puede que entonces el antibiótico natural lo necesites justo o, directamente, ya no lo necesites.

Sin duda, en la alimentación es dónde deberemos poner mayor foco sobre la microbiota, ya que de ésta depende como proteger o alterar y sobre todo, reequilibrar la barrera natural del intestino.

Errores frecuentes en la consulta de microbiota

Lorena: En las aulas virtuales del máster, ¿cuáles son los errores frecuentes o las dudas que más se repiten en los alumnos cuando llegan para tratar patologías de moda como la disbiosis o el Helicobacter Pylori?

Antonio Valenzuela: El error principal que hemos tenido todos es pensar que allí donde se encuentra el síntoma se encuentra la causa.

  • Cistitis de repetición: Se tiende a hacer un tratamiento enfocado exclusivamente en la vejiga, en el tracto geniturinario, o en dar el mejor probiótico vaginal. A lo mejor el problema viene a nivel de intestino, y lo que hay que hacer primero es mirar el intestino antes que el aparato geniturinario.
  • Patologías del intestino grueso: Ante una disbiosis por enfermedad inflamatoria intestinal, un Crohn o cualquier patología del colon, no se piensa que el primer sitio al que tenemos que mirar es la boca o el estómago.

Queremos buscar el “sota, caballo y rey”: «tengo esta bacteria, voy a dar esta molécula que la va a matar y el problema se va a solucionar». No se comprende que la salud es un sistema muy complejo en el cual interactúan muchas variables. En PNI siempre decimos que no tratamos patologías, tratamos a personas. El esposoma de la persona y su contexto son superimportantes.

Herramientas clínicas y protocolos: El equilibrio formativo

Lorena: Muchas veces queremos el protocolo estándar, el “A + B = C”. Pero la realidad clínica requiere personalización, un proceso diagnóstico que mire a la causa más allá del síntoma. El síntoma es solo el chivato del coche que se enciende.

Antonio Valenzuela: Totalmente, pero tampoco hay que perder el otro extremo. Pensando en el alumno, dar esa visión integrativa está fenomenal, pero también necesitamos protocolos. Sobre todo al principio, la persona necesita tener unos criterios de actuación claros: saber qué vitaminas, qué minerales, qué plantas, qué suplementación dar y qué pautas de estilo de vida aplicar cuando el diagnóstico es firme.

He estado en formaciones donde se hablaban 7 horas de cada tipo de bacteria pero luego eso no se sabía trasladar a la práctica clínica. Los profesores del máster tenemos muy claro que no queremos dar paja. Los alumnos son profesionales de la salud y su tiempo es vida. Queremos que cada minuto se traduzca en herramientas prácticas que apliquen desde el día uno. Si hay un problema de hipoclorhidria en el estómago y no se está produciendo ácido clorhídrico, el alumno debe saber exactamente qué dar y qué hacer para mejorar eso. No es buscar el protocolo a ciegas, es saber el orden exacto en el que se aplica tras el proceso diagnóstico.

El “Dream Team” de la Microbiota: Un mapa de ruta anatómico

El plan de estudios del máster está diseñado siguiendo la lógica anatómica y fisiológica del tubo digestivo, contando con docentes que son referentes clínicos en activo:

  • Microbiota Oral: Impartida por Eider Unamuno, un auténtico cañón en la gran olvidada de la salud digestiva.
  • Estómago y Sistema Inmune: A cargo de Mariana Aróstegui. Cuenta con más de mil estrategias prácticas para regular las bacterias proteolíticas a nivel estomacal, recuperar la capacidad ácida y modular la inmunidad.
  • Intestino Delgado y SIBO: Liderado por Asun González (bióloga molecular y nutricionista, autora de dos libros de referencia sobre el SIBO bajo una visión 360).
  • Intestino Grueso: Desarrollado por David Granizo, especialista en la fisiología del colon.
  • Salud Hormonal y Urogenital: Asignatura de Tony Carmona, experto de primera índole en conectar el eje hormonal con el microbioma.
  • Dermobiota (La piel): Impartida por la Dra. Almudena Nuño (dermatóloga de prestigio internacional). Enseña el componente microbiológico tan potente que tienen patologías como la rosácea, la psoriasis, el vitíligo, la dermatitis seborreica o la caspa. La piel es el espejo del aparato intestinal.
  • Nutrición Evolutiva y Longevidad: Liderada por Lorena Cervantes. Aborda desde la ventana de los primeros 1.000 días de vida hasta las pautas de alimentación en la tercera edad para mantener las bífidobacterias, claves en la longevidad.
  • Alimentos Fermentados: Co-impartida junto a Javi Maestu (autor del libro Entre Fermentos), aportando un carácter culinario y organoléptico para que los profesionales aprendan a elaborar y prescribir chucrut, kimchi o kombucha como alimentos vivos funcionales.

Nuestro equipo docente lo forman médicos, fisioterapeutas, nutricionistas, psicólogos y psiconeuroinmunólogos, todos ellos dedicados a la PNI, que actualmente ejercen su profesión combinándola con la docencia, la investigación y la divulgación.

Desmitificando el diagnóstico: El valor de los test de microbiota

Lorena: La asignatura de valoración funcional la imparte Miguel Toribio. Él aporta toda la parte de actualización científica y diagnóstico de una forma muy estructurada.

Antonio Valenzuela: Miguel Toribio es un profesional tan transversal que podría dar cualquier asignatura del máster de manera sobresaliente. Ha sido el director científico de Atlas Biomet, un laboratorio muy puntero de test de microbiota y nutrigenómica, por lo que tiene toda la experiencia del mundo supervisando miles de análisis.

Pero lo extraordinario de tener a Miguel es justamente el extremo contrario: hoy día se piensa que si no tienes un test de microbiota, no puedes tratar al paciente. Miguel viene precisamente a desmitificar esto. Te va a enseñar que en el 90% de los casos no necesitas un test de microbiota para tratar a un paciente.

Viene a romper la visión clásica y sesgada de mirar qué bacteria está alta para matarla o cuál está baja para darle un probiótico. Eso no es medicina integrativa. Él enseña a ver a las personas como personas y no como “test con patas”. Además, Miguel es un investigador neurocientífico que vive en Reino Unido y aporta una parte espectacular sobre el impacto de la modulación de la microbiota en el TDAH y el autismo, un campo en el que ha enfocado sus estudios científicos y sus libros (Cuerpo y mente TDAH).

La Guinda del Pastel: El eje intestino-cerebro

Lorena: La asignatura 12 aborda el eje intestino-cerebro, esa carretera de doble sentido. Cuéntanos qué descubrimientos te marcaron en tu carrera respecto a la influencia de la microbiota en la salud emocional y neurológica.

Antonio Valenzuela: Es una asignatura que disfruto muchísimo. Estudiamos cómo lo que ocurre en el intestino impacta en nuestro cerebro y cómo las emociones impactan de manera bestial en todo el aparato digestivo y en la microbiota. Vemos de forma manifiesta esta bidireccionalidad en trastornos como la ansiedad y la depresión, la demencia o el Parkinson.

El Parkinson, por ejemplo, está muy olvidado y es, en su inicio, una enfermedad intestinal con manifestaciones posteriores en el sistema nervioso. Mira qué relación más interesante vemos en la clínica: personas mayores que, tras un tratamiento largo con protectores de estómago (Omeprazol), empiezan a manifestar trastornos parkinsonianos.

¿Qué está pasando ahí? Intervienen dos factores:

  1. Helicobacter Pylori: Una tasa de replicación alta de esta bacteria en el estómago genera toxinas que son muy neurotóxicas. Aumentan el patrón de marcha parkinsoniana en el adulto mayor. Cuando tratas el terreno y mejoras el control sobre el Helicobacter, la cadencia de la marcha de esa persona mejora. Muchas veces no es un Parkinson idiopático, es un Helicobacter Pylori generando una manifestación parkinsoniana.
  2. Vitaminas del grupo B (B6 y B12): Necesitan obligatoriamente la acidez estomacal para absorberse. La B6 es crítica en estos pacientes. Al recuperar la capacidad de producir ácido en ese estómago, absorben mejor las vitaminas y reducen su sintomatología neurodegenerativa.

El modelo de la esclerosis múltiple

Antonio Valenzuela: Otro de mis contactos más poderosos con la neurología integrativa fue en Estados Unidos con la Dra. Terry Wahls. Ella padece esclerosis múltiple, estuvo postrada en una silla de ruedas y hoy en día realiza actividad física de alto impacto (burpees). Revirtió su situación a través del estilo de vida porque la farmacología no la mejoraba.

Hace unos años realicé en España un programa clínico grupal para pacientes con esclerosis múltiple enfocado en la mejora de sus hábitos. A día de hoy, cuando vienen a la firma de mis libros, todavía me dicen: «Antonio, jolín lo que me cambió la vida el manejo integrativo de la esclerosis múltiple y el cambio en mi microbiota. Desde que me alimento pensando en mejorar mis bacterias, cómo he mejorado». Es algo tremendamente gratificante. Cualquier enfermedad autoinmune no se puede entender ni tratar sin el contexto del microbioma humano.

El mensaje para los profesionales de la salud en 2026

Lorena: Para aquellos profesionales que se están planteando dar el salto a la cuarta edición del Máster de Microbiota de Regenera, ¿cuál es tu mensaje final?

Antonio Valenzuela: Que se animen, porque se lo van a pasar muy bien. Las personas que nos están escuchando son, como mínimo, igual de frikis de la salud que yo. Como director del máster he supervisado todas las asignaturas y os aseguro que escuchar a este elenco de profesores es un absoluto privilegio.

Es una formación radicalmente distinta a esos cursos planos, ultra teóricos con docentes que no comunican. Aquí contamos con personas vivas, vitales, que transmiten energía y experiencia clínica real. No solo van a adquirir un conocimiento científico de vanguardia para trasladar a sus pacientes desde el primer día, sino que lo van a disfrutar de verdad.

Entonces… ¿dónde estudiar microbiota intestinal?

Formarte en microbiota es adentrarte en un territorio donde ciencia y práctica se encuentran. Entre sus beneficios:

  • 📚 Actualización científica constante: dominarás los últimos hallazgos sobre probióticos, prebióticos y simbióticos.
  • 💻 Flexibilidad total: aprende a tu ritmo, con clases grabadas, tutorías en directo y materiales descargables.
  • 👩‍⚕️ Enfoque clínico e integrativo: aplicarás lo aprendido directamente a tus pacientes o a tu propia salud.
  • 🎓 Certificación universitaria reconocida: el Máster de Regenera está adscrito a la universidad y equivale a un Máster en Formación Permanente en España (60 ECTS).

La formación más completa y actualizada de Regenera. El Máster Profesional en Microbiota online de Regenera es una experiencia de aprendizaje inmersiva que conecta ciencia, clínica y autoconocimiento.

Dirigido tanto a profesionales sanitarios como no sanitarios, su objetivo es enseñarte a ver la microbiota como la pieza que conecta todos los problemas de salud de un paciente y te brinda herramientas para solucionarlos de forma real y duradera.

🎓 Características principales

  • Título propio de la Facultad de Medicina Integrativa Regenera, adscrita a la Facultad.
  • Equivalente a un Máster en Formación Permanente (60 ECTS).
  • Duración: 1 año académico.
  • Inicio: 28 de septiembre de 2026.
  • Modalidad: 100 % online y flexible.
  • Estructura: 12 asignaturas, cada una de 4 semanas, con entre 8 y 15 horas de contenido teórico-práctico.
  • Metodología: clases en vídeo, tutorías en directo con profesores, apuntes descargables y evaluaciones formativas.
  • Acompañamiento: tutor personal y comunidad de aprendizaje con otros profesionales.

Sobre el autor

Reportajes y artículos relacionados en Regenera

Clínica PNI Regenera:
curar desde la raíz

Especialistas que te escucha de verdad y entienden lo que te está pasando.

☑️ Digestivo y metabolismo
☑️ Autoinmunidad e inflamación
☑️ Salud hormonal y tiroides
☑️ Cardiovascular
☑️ Neurología y dolor crónico
☑️ Infecciones y virus persistentes
☑️ Salud emocional
☑️ Sistema nervioso
☑️ Pediatría integrativa

Scroll al inicio

Formación Académica

– Licenciada en Medicina por la Universidad Autónoma de Madrid (1998 a 2004).

– Especialista en Cirugía Torácica (2005 a 2010).

– Ampliación de estudios de especialistas con estancia de 3 meses en la Mayo Clinic de Rochester, Minnesota (Estados Unidos) (2011).

Doctora en Ciencias Médico-Quirúrgicas por la Universidad Complutense de Madrid con el trabajo: “Efectividad de una consulta monográfica para el estudio de lesiones pulmonares en la reducción del tiempo de demora hasta la intervención quirúrgica”, con la calificación final de Sobresaliente-Cum Laude. Marzo de 2025.

– Máster Propio en Oncología Torácica por la Universidad CEU Cardenal Herrera (2018 a 2019).

– Postgrado en Microbiota por Regenera University (2022).

– Máster en Psiconeuroinmunología Clínica por Regenera University (2022 a 2024).

– Postgrado en Pediatría Integrativa por Regenera University (2025).

Experiencia Profesional

– Médico Interno Residente (MIR) de Cirugía Torácica, Hospital Clínico San Carlos de Madrid (2005 – 2010).

– Médico especialista en Cirugía Torácica, Hospitales Sagrat Cor, Quirón, Dexeus y Teknon de Barcelona (2010).

– Médico especialista en Cirugía Torácica, Hospital Clínico San Carlos de Madrid, (2010 hasta la actualidad).

– Médico especialista en Psiconeuroinmunología Clínica, Clínicas Regenera (2024 hasta la actualidad).

Logros y Reconocimientos

Premio Brompton de la ESTS a la mejor comunicación de la 16th European Conference on General Thoracic Surgery, celebrada en Bologna (Italia), 2008.

– Profesor Colaborador del Departamento de Cirugía I de la Facultad de Medicina de la Universidad Complutense de Madrid desde 2005.

Experta en diagnóstico y tratamiento del carcinoma de pulmón. Responsable de la consulta de nódulo pulmonar y del programa de broncoscopia con navegación en el H. Clínico San Carlos, desde 2015.

 

-Miembro del Comité Multidisciplinar de Tumores Mesenquimales-Sarcomas del H. Clínico San Carlos, siendo este CSUR (centro de referencia nacional) para esta patología.

 

– Vocal de la Junta Directiva de la Sociedad Española de Cirugía Torácica (2008 a 2010), tesorera (2010 a 2014) y miembro del Comité de Formación y Docencia (2018 a 2023).

Tutora de residentes de Cirugía Torácica del H. Clínico San Carlos de Madrid (2013 a 2021).

Responsable de Humanización por parte del servicio de Cirugía Torácica en el H. Clínico San Carlos.

Publicaciones en revistas nacionales (21) e internacionales (7) y capítulos de libros (8). Comunicaciones orales en congresos nacionales (28) e internacionales (7). Ponencias en congresos y cursos nacionales (18). 21 proyectos de investigación, siendo Co-IP en 2 de ellos.

-Dentro de la PNI especialista en abordaje de sistema digestivo, tiroides, autoinmunidad y oncología integrativa.

-Co-directora del Máster en Psiconeuroinmunología Clínica por Regenera University desde 2025.